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JOSEP respondido al tema 'Consulta: guía sobre análisis' en el foro. 2 semanas

Hola Juan, voy a intentar responder a todas tus preguntas, particularmente solo utilizo el recurso de los análisis moleculares cuando con la microscopía no puedo llegar a ninguna conclusión medianamente convincente, y ya te anticipo que no resulta nada barato.
Las muestras las tienes que enviar a algún laboratorio que trabaje con la biología molecular, allí deben proceder a la extracción del ADN de las muestras, luego una amplificación por PCR, y ya solo queda la secuenciación, en lo que se refiere a los hongos, el gen más utilizado es el ITS, todo este proceso suele salir con un coste por muestra de entre 20 y 22 euros.
En muchos casos ni aún así es posible el llegar a ninguna conclusión, sea por una posible contaminación de la muestra (ruido) o por una defectuosa extracción del ADN, por lo que se debe recurrir a lo que se denomina "reversa", o a utilizar quids como por ejemplo el de "basidiomicetos premier", o a una nueva extracción lo que ya eleva notablemente los costes.
En muchos casos suele suceder que el gen ITS por si solo no resulta aclaratorio, por lo que se debe recurrir a otros genes, como el gen LSU, el gen rpb2, el gen tef 1 , etc., etc.
Tengo especies con 4 genes secuenciados y a día de hoy aún pendientes de nombre.
Ya podrás comprobar que recurrir al análisis molecular no lo considero ni necesario y ni mucho menos rentable, ya que en ocasiones y debido a la mala calidad de los datos depositados en Genbank, tampoco resulta fiable el resultado, te dejo el enlace de un trabajo mío en el que después de repetir por dos veces la secuenciación, no estoy para nada de acuerdo con el resultado, es mas estoy seguro al 100% que el resultado es del todo erróneo.
www.fungipedia.org/setas-informacion-y-c...or-buena.html#106963
En cuanto a la especie que nos muestras lo más parecido que conozco estaría por Exidia thuretiana, pero sin micro imposible el poder concretar algo.
Saludos smile.png

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